11月11日,中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)腫瘤病理專業(yè)委員會(huì)分子病理協(xié)作組和腫瘤標(biāo)志專業(yè)委員會(huì)遺傳性腫瘤標(biāo)志物協(xié)作組聯(lián)合編撰的《腫瘤突變負(fù)荷檢測(cè)及臨床應(yīng)用中國(guó)專家共識(shí)(2020年版)》在《中國(guó)癌癥防治雜志》正式發(fā)表,共識(shí)圍繞TMB的定義、臨床意義、檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化及與其他免疫標(biāo)志物如PD-L1、dMMR/MSI-H的關(guān)系等要點(diǎn),為臨床提供8條TMB檢測(cè)及應(yīng)用共識(shí)推薦,以期最大可能提高免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICIs)治療療效預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性。
1、TMB的定義
專家共識(shí):TMB一般是指特定區(qū)域內(nèi)體細(xì)胞非同義突變的個(gè)數(shù),通常用每兆堿基有多少個(gè)突變表示(XX個(gè)突變/Mb)。TMB評(píng)估受樣本質(zhì)量和數(shù)量、檢測(cè)基因組大小、生信分析方法等多種因素影響,臨床應(yīng)用前應(yīng)了解TMB的適用范圍。不同檢測(cè)方法獲得的TMB應(yīng)進(jìn)行系統(tǒng)評(píng)估,判斷是否具有可比性。TMB數(shù)值可反映腫瘤內(nèi)產(chǎn)生腫瘤新抗原的潛力,與DNA修復(fù)缺陷密切相關(guān),在多種腫瘤中dMMR和MSI-H患者具有較高的TMB。
2、TMB的臨床意義
2.1 組織TMB可作為免疫治療獨(dú)立的療效預(yù)測(cè)生物標(biāo)志物
專家共識(shí):組織TMB(tTMB)是一個(gè)新興的獨(dú)立ICIs治療療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物,與多種腫瘤類型ICIs單藥或兩種ICIs聯(lián)合治療的療效相關(guān),已證實(shí)可作為泛癌種免疫治療療效的預(yù)測(cè)標(biāo)志物。推薦既往標(biāo)準(zhǔn)治療后疾病進(jìn)展且沒(méi)有更好替代療法的實(shí)體瘤患者,尤其是高TMB的患者進(jìn)行TMB檢測(cè),有助于擴(kuò)大免疫治療獲益人群。中國(guó)人群 TMB的獨(dú)立預(yù)測(cè)價(jià)值仍需更多前瞻性研究驗(yàn)證。
2.2 血液TMB與tTMB具有顯著相關(guān)性
專家共識(shí):目前研究證據(jù)顯示在NSCLC中血液TMB(bTMB)與tTMB具有顯著相關(guān)性,但bTMB檢測(cè)無(wú)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。多項(xiàng)回顧性研究發(fā)現(xiàn)高bTMB與NSCLC患者接受單藥ICIs治療獲益顯著相關(guān),但尚未獲得高級(jí)別前瞻性臨床研究證實(shí)。
3、TMB檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)化
3.1 樣本收集、處理原則
專家共識(shí):推薦使用近期石蠟包埋腫瘤組織樣本進(jìn)行tTMB檢測(cè),待檢測(cè)組織應(yīng)首先完成病理質(zhì)控并確保惡性腫瘤細(xì)胞數(shù)能夠滿足檢測(cè)要求。為過(guò)濾胚系突變對(duì)后續(xù)tTMB評(píng)估的影響,應(yīng)采集患者外周血、唾液或正常組織作為對(duì)照樣本。建議優(yōu)先采用NMPA批準(zhǔn)上市的核酸提取試劑盒進(jìn)行基因組DNA提取,tTMB檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)實(shí)際需求建立合適的DNA樣品質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)和操作流程,對(duì)待測(cè)DNA樣品純度、濃度及片段化程度進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控。腫瘤原發(fā)灶與遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移灶組織均可用于tTMB評(píng)估。
3.2 TMB檢測(cè)的Panel設(shè)計(jì)和平臺(tái)選擇
專家共識(shí):采用靶向測(cè)序Panel進(jìn)行TMB評(píng)估時(shí),建議與WES評(píng)估的TMB進(jìn)行一致性評(píng)價(jià)。靶向測(cè)序Panel覆蓋范圍原則上不應(yīng)<1.0 Mb,最低有效測(cè)序深度應(yīng)≥500×。建議進(jìn)行TMB檢測(cè)的靶向測(cè)序Panel盡可能涵蓋患者更多的其他分子遺傳信息,包括可指導(dǎo)靶向治療的驅(qū)動(dòng)基因突變、與基因變異產(chǎn)生相關(guān)的免疫治療正向預(yù)測(cè)因子以及可能的免疫治療負(fù)向預(yù)測(cè)因子。目前已有多款NGS測(cè)序儀獲國(guó)家NMPA批準(zhǔn)用于臨床基因檢測(cè),不同實(shí)驗(yàn)室可依據(jù)樣本量、時(shí)效要求選擇不同測(cè)序平臺(tái)。
3.3 TMB算法的標(biāo)準(zhǔn)化要求
專家共識(shí):基于靶向測(cè)序Panel的TMB檢測(cè)應(yīng)以WES檢測(cè)為金標(biāo)準(zhǔn),納入影響蛋白質(zhì)編碼的體細(xì)胞突變,應(yīng)保證檢出突變頻率≥5%的體細(xì)胞突變,以保證TMB檢測(cè)值的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性;應(yīng)依托ICIs療效隨訪數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)基因組比對(duì)和突變檢出算法開展標(biāo)準(zhǔn)化研究;Panel檢測(cè)區(qū)域可影響TMB值,應(yīng)通過(guò)至少1 000例WES數(shù)據(jù)予以校正。同時(shí)建議使用對(duì)照樣本過(guò)濾胚系變異。
3.4 TMB閾值的探索與臨床應(yīng)用
專家共識(shí):TMB值在不同癌種中存在顯著差異,應(yīng)依據(jù)ICIs臨床療效確定閾值,才能最大可能篩選出ICIs治療的潛在獲益人群。值得注意的是,不同靶向測(cè)序Panel的TMB檢測(cè)體系之間TMB閾值不能通用。
3.5 TMB報(bào)告模板的初步建議
專家共識(shí):TMB報(bào)告內(nèi)容除重點(diǎn)描述TMB計(jì)算原則和數(shù)值外,還應(yīng)針對(duì)癌種的免疫治療意義進(jìn)行解讀;同時(shí)還需系統(tǒng)評(píng)估Panel檢測(cè)的各種驅(qū)動(dòng)基因突變情況,以全面解患者的腫瘤生物學(xué)特征,建議應(yīng)用分子腫瘤診治專家組模式(MTB)進(jìn)行臨床輔助決策。
4、TMB聯(lián)合應(yīng)用展望
作為一個(gè)新興的ICIs治療療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物,TMB在臨床應(yīng)用中還處于初始階段,檢測(cè)技術(shù)還在不斷完善,臨床意義也在不斷豐富。最近有研究發(fā)現(xiàn),TMB與其他腫瘤免疫治療相關(guān)標(biāo)志物(如PD-L1、MSI)聯(lián)合應(yīng)用,或能提高免疫治療療效預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和精確性,但具體的聯(lián)合策略還需要進(jìn)一步探索。
參考資料:
中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)腫瘤標(biāo)志專業(yè)委員會(huì)遺傳性腫瘤標(biāo)志物協(xié)作組, 中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)腫瘤病理專業(yè)委員會(huì)分子病理協(xié)作組. 腫瘤突變負(fù)荷檢測(cè)及臨床應(yīng)用中國(guó)專家共識(shí)(2020年版)[J]. 中國(guó)癌癥防治雜志, 2020, 12(5): 485-494.