研究同倍體雜交物種形成的難點(diǎn)在于,檢驗(yàn)雜交直接影響生殖隔離的形成。7月6日,中國(guó)科學(xué)院西雙版納熱帶植物園副研究員孫永帥研究團(tuán)隊(duì)在Nature Communications發(fā)表了題為Genomic basis of homoploid hybrid speciation within chestnut trees的研究論文。該研究以中國(guó)特有的峨眉錐栗研究系統(tǒng)為材料,應(yīng)用進(jìn)化生態(tài)研究方法,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)樹木雜交物種以及生殖隔離位點(diǎn)的分布式樣,揭示了自然選擇與重組的互作是塑造生物基因組進(jìn)化的重要機(jī)制。物種形成模型可分為二歧分支式物種形成和雜交物種形成。在二歧分支模型中,每個(gè)物種只對(duì)應(yīng)一個(gè)祖先群體,而雜交物種則源自于兩個(gè)或多個(gè)類群。進(jìn)一步地,雜交成種分為多倍體雜交成種和同倍體雜交物種形成。多倍體物種形成較常見(jiàn)于植物界,而同倍體雜交物種形成類群頗為少見(jiàn),迄今有5個(gè)認(rèn)可度較高的同倍體雜交物種形成類群均分布在美洲?,F(xiàn)存物種及類群間的生殖隔離強(qiáng)度往往高于其祖先群體間的隔離強(qiáng)度。研究團(tuán)隊(duì)將這一原理引入到進(jìn)化生態(tài)學(xué)與交叉研究中,即在與生殖隔離關(guān)聯(lián)的基因組區(qū)域上,現(xiàn)存類群間的基因流應(yīng)低于其祖先群體間的基因流。在生殖隔離位點(diǎn)上,親本物種的等位基因往往因環(huán)境、限制而不能共存?;谶@些原理,該團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)用群體方法鑒定了中華板栗(也稱板栗)和錐栗的生殖隔離位點(diǎn),進(jìn)而用之檢驗(yàn)峨眉錐栗是否起源于板栗和錐栗間雜交。與此前研究報(bào)道的5個(gè)同倍體雜交成種的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)不同,在峨眉錐栗雜交系統(tǒng)中,板栗和茅栗的姐妹種對(duì)關(guān)系為鑒定板栗和錐栗的生殖隔離位點(diǎn)提供了天然對(duì)照和便利。該研究首先用多個(gè)方法分析峨眉錐栗與板栗、錐栗的遺傳差異,為峨眉錐栗的分類地位提供了證據(jù)。然后,采用hhs方法、溯祖模型比較分析等對(duì)峨眉錐栗的雜交起源過(guò)程進(jìn)行解析,并估算親本物種對(duì)峨眉錐栗基因組的相對(duì)貢獻(xiàn)。該研究鑒定了與生殖隔離關(guān)聯(lián)的候選基因組位點(diǎn)。在峨眉錐栗基因組中,僅6個(gè)生殖隔離位點(diǎn)來(lái)自于板栗?;蚬δ茏⑨尫治霭l(fā)現(xiàn)兩個(gè)花期關(guān)聯(lián)基因位于本研究鑒定的生殖隔離關(guān)聯(lián)位點(diǎn)上。這些結(jié)果表明,親本物種間生殖隔離位點(diǎn)的重新組合可為新物種形成的重要機(jī)制。研究人員深入分析發(fā)現(xiàn),候選生殖隔離位點(diǎn)偏集中分布于基因組的低重組區(qū)域。研究結(jié)果認(rèn)為,自然選擇和重組間互作塑造了峨眉錐栗基因組的進(jìn)化過(guò)程。(100yiyao.com)
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